Генетическая фонетика может быть уловкой для определения смысла ДНК. случай, пара оснований за парой оснований.

Но исследователи Университета Флориды разработали вычислительный метод, который больше похож на чтение целых слов за раз.

В мире, где способность науки расшифровывать генетический код организма растет с каждым днем ​​все быстрее, этот метод может предложить столь необходимую эффективность в преобразовании, казалось бы, бесконечной цепочки символов в информацию, которая может излечить болезнь или создать новые культуры.

Исследователи из Института пищевых и сельскохозяйственных наук Университета штата Флорида и Института генетики Университета штата Флорида опубликовали свою проверку метода в опубликованном в среду онлайн-журнале PLoS ONE, выпускаемом Публичной научной библиотекой.

«Мы очень много работали, чтобы найти способы сбора генетической информации», — сказал Жунлин Ву, ведущий исследователь проекта и профессор Исследовательского фонда UF.

«Теперь мы должны усердно работать, чтобы найти способы его использования».

Во многих отношениях исследователи представляют геном организма как бегущую строку из четырех букв, представляющих четыре аминокислотных основания, повторяющихся в разном порядке. Цель состоит в том, чтобы найти смысл в последовательностях, выяснить, как изменения в паттерне влияют на физиологию организма.

Например, у людей в коде 3 миллиарда букв. Между любыми двумя из нас 99,9% этих писем совпадают. Но именно эти последние 0,1 процента различий, разбросанные по всей нашей ДНК в виде однобуквенных изменений, объясняют нашу уникальную идентичность — от цвета глаз до предрасположенности к болезням.

Эти различия называются однонуклеотидными полиморфизмами или SNP (произносится как «снипы»).

Самый простой способ выяснить, как SNP влияет на организм, — это собрать группу организмов, в генетическом коде которых есть разные варианты этой буквы.

Но на физические черты обычно влияют множественные SNP, которые взаимодействуют иногда непредсказуемым образом — подобно тому, как «е» в конце слова может изменить его произношение.

К счастью, правила генетики гласят, что SNP, влияющие на один и тот же признак, обычно каким-то образом связаны друг с другом, например, находятся рядом друг с другом.

Модель Ву использует эти правила в сочетании со статистическим анализом реальных данных от генетически картированных организмов. В результате модель может найти целые группы SNP, связанные с физическим признаком.

Точно так же, как понимание общих фонетических принципов позволяет читателю произносить целое слово, дополнительные знания генетики позволяют модели Ву находить целые картины геномных/физических корреляций.

«Настоящее обещание работы Ву заключается в том, что она может дать исследователю возможность не тратить действительно обескураживающее количество времени на разбор отдельных нуклеотидов, а перейти непосредственно к выполнению той генетической работы, которая будет иметь большее значение. значения», — сказал Рори Тодхантер, исследователь, работающий в области генетики собак в Корнельском университете.

В документе исследователи проверили свою модель, используя генетическую и физическую информацию о мышах, которая впервые была собрана в лаборатории Джеймса Чеверуда в Вашингтонском университете в середине 1990-х годов. Затем они сравнили свои результаты с результатами генетического анализа за несколько лет.

Это подтверждение было важным, сказал Вэй Хоу, первый автор статьи и доцент кафедры эпидемиологии и политики здравоохранения Университета штата Нью-Йорк. Но анализ современных данных станет настоящим ключом к важности метода. Например, генетическая информация мыши, использованная в этой статье, содержала всего несколько тысяч SNP. 29 июляв выпуске журнала

Nature упоминается более 8 миллионов SNP для генома мыши.

«Это показывает, как нам нужно выйти за рамки рассмотрения геномов SNP за SNP», — сказал Чеверуд. «Представьте, какая работа предстоит нам, если мы этого не сделаем».

Источник: УФ

Цитата : Генетическая фонетика может быть уловкой для определения значения ДНК (2007, 16 августа) получено 11 мая 2023 г. с https://phys.org/news/2007-08-genetic-phonetics-dnas.html

Этот документ защищен авторским правом. Помимо любой добросовестной сделки с целью частного изучения или исследования, никакие часть может быть воспроизведена без письменного разрешения. Контент предоставляется только в ознакомительных целях.

Есть ли у звучности фонетическая основа? | Современные взгляды на архитектуру и репрезентации в фонологии | Стипендия MIT Press онлайн

Фильтр поиска панели навигации Стипендия MIT Press OnlineСовременные взгляды на архитектуру и представления в фонологииКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКнигиЖурналыOxford Academic Мобильный телефон Введите поисковый запрос

Закрыть

Фильтр поиска панели навигации Стипендия MIT Press OnlineСовременные взгляды на архитектуру и представления в фонологииКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКнигиЖурналыOxford Academic Введите поисковый запрос

Расширенный поиск

• Иконка Цитировать Цитировать

• Разрешения
• Делиться
  • Твиттер
  • Еще

Укажите

Клементс, Г. Н., «Есть ли у звучности фонетическая основа?», Эрик Рэйми и Чарльз Э. Кэрнс (редакторы), Contemporary Views on Architecture and Representations in Phonology (

Cambridge, MA

, 2009; онлайн-издание, MIT Press Scholarship Online, 22 августа 2013 г.), https://doi.org/10.7551/mitpress/9780262182706.003.0007, по состоянию на 11 мая 2023 г.

Выберите формат Выберите format.ris (Mendeley, Papers, Zotero).enw (EndNote).bibtex (BibTex).txt (Medlars, RefWorks)

Закрыть

Фильтр поиска панели навигации Стипендия MIT Press OnlineСовременные взгляды на архитектуру и представления в фонологииКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКнигиЖурналыOxford Academic Мобильный телефон Введите поисковый запрос

Закрыть

Фильтр поиска панели навигации Стипендия MIT Press OnlineСовременные взгляды на архитектуру и представления в фонологииКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКогнитивная лингвистикаЛингвистические теорииФонетика и фонологияКнигиЖурналыOxford Academic Введите поисковый запрос

Advanced Search

Abstract

Согласно Берту Во и Эндрю Вулфу, слоговое преобразование универсально соответствует Принципу последовательности звучности, согласно которому сегменты в слоге повышаются по звучности от края к пику.

Понятие звучности занимает важное место в фонологии и фонетике, даже несмотря на то, что точные фонетические корреляты для него остаются неуловимыми, а некоторые ученые предполагают, что оно не имеет фонетической основы. В этой главе утверждается, что звучность связана с резонансом звуков речи, а не с громкостью или слышимостью.

Ключевые слова: резонанс, Берт Во, Эндрю Вульф, слоговое преобразование, Принцип последовательности звучности, звучность, фонология, фонетика, звуки речи

Предмет

Фонетика и фонология Когнитивная лингвистикаЛингвистические теории

В настоящее время у вас нет доступа к этой главе.

Войти

Получить помощь с доступом

Получить помощь с доступом

Доступ для учреждений

Доступ к контенту в Oxford Academic часто предоставляется посредством институциональных подписок и покупок. Если вы являетесь членом учреждения с активной учетной записью, вы можете получить доступ к контенту одним из следующих способов:

Доступ на основе IP

Как правило, доступ предоставляется через институциональную сеть к диапазону IP-адресов. Эта аутентификация происходит автоматически, и невозможно выйти из учетной записи с IP-аутентификацией.

Войдите через свое учреждение

Выберите этот вариант, чтобы получить удаленный доступ за пределами вашего учреждения. Технология Shibboleth/Open Athens используется для обеспечения единого входа между веб-сайтом вашего учебного заведения и Oxford Academic.

1. Нажмите Войти через свое учреждение.
2. Выберите свое учреждение из предоставленного списка, после чего вы перейдете на веб-сайт вашего учреждения для входа.
3. Находясь на сайте учреждения, используйте учетные данные, предоставленные вашим учреждением. Не используйте личную учетную запись Oxford Academic.
4. После успешного входа вы вернетесь в Oxford Academic.

Если вашего учреждения нет в списке или вы не можете войти на веб-сайт своего учреждения, обратитесь к своему библиотекарю или администратору.

Войти с помощью читательского билета

Введите номер своего читательского билета, чтобы войти в систему. Если вы не можете войти в систему, обратитесь к своему библиотекарю.

Члены общества

Доступ члена общества к журналу достигается одним из следующих способов:

Войти через сайт сообщества

Многие общества предлагают единый вход между веб-сайтом общества и Oxford Academic. Если вы видите «Войти через сайт сообщества» на панели входа в журнале:

1. Щелкните Войти через сайт сообщества.
2. При посещении сайта общества используйте учетные данные, предоставленные этим обществом. Не используйте личную учетную запись Oxford Academic.
3. После успешного входа вы вернетесь в Oxford Academic.

Если у вас нет учетной записи сообщества или вы забыли свое имя пользователя или пароль, обратитесь в свое общество.

Вход через личный кабинет

Некоторые общества используют личные учетные записи Oxford Academic для предоставления доступа своим членам. См. ниже.

Личный кабинет

Личную учетную запись можно использовать для получения оповещений по электронной почте, сохранения результатов поиска, покупки контента и активации подписок.

Некоторые общества используют личные учетные записи Oxford Academic для предоставления доступа своим членам.

Просмотр учетных записей, вошедших в систему

Щелкните значок учетной записи в правом верхнем углу, чтобы:

• Просмотр вашей личной учетной записи и доступ к функциям управления учетной записью.